Protein

UniProt accession
M4SML5 [UniProt]
Protein name
Virion RNA polymerase
PhaLP type
VAL

evidence: Protein name annotation

probability: 99 % (predicted by ML model)

Protein sequence
MANILYGSDAVAQVEAAEGPLSSTERRIVELEGLADGTYADTKGIATSGVGQTGQFANMSFKDTVATFEEETRRMIPNFDSLSPKLQTELVQAAYRGDLQQSPKTRALINEGNFEGAAQEFLNNQEFQTTPYNAIRDRMADVSTALAAEGAQAPVAPSVGEQKQVQLANRTPQKQQQVANTSDSKQLELAGLSQAEQRILDLGMSEYVRNGQTGTAASRAQEYMDAQDKLSTIQQRQDEESTKVIFEDLDNPLQATGNTLLSVANTIGNIAGGLVSLPSSIRSAYNLSDATNEGFAQYQSILAKEQAGVALTPAEREFQGTDEYSDIKQGMESMARAQSIQGGFGILGDYVNQELTTEFVNEGSKLFNEVAGGDITMGEFISESARLLTQSPGAIGQATVESLPYVLASAYNLPLTVASGWANNQQEALEEYQKNNDGAIPTGRDLANVTMLAGGQALVDHFGDRLVGGKNLKNLISGATGRRSAGAAVGVVQGTAGEFVAEGGAEVLGQLAATAGKGEVDLAQAYAAGLLGAGAGGATSGAIAGANITADAIDNAPDLGEKVSSVSERAKGAVESVKTAATEAKDAATKAAQTTTEEQTEAPTEEKGLDVRLSEAFVESDSNPDQAQTIEADVRAEYDALKTEAQDIVKSGVTNETITEEQKDTIIRFQEAQKVIRARNKEVKAREAAKQANQLATASTNNTATTTAVENVLGSIELDPSSISADQAEAILGNQNLRLDAEQRSKLQHHVRVAKTLDEVSNEIRDGGNGNIGINQYIEEVGAALEIGDVATATESLDALKAWQQQHVAKLQSNVHNGKPMTPRLRAQVAKEVKAMNAAVAKLENDLIYADAPTQEEQANVDANVPTTDTVSGSATNDTETVAEQQAPEAVAEDAPAAEATQDQVTAELREIFQELDSDPALVDQVVTGVLDLNEQGVTFDSALTSLKEQYGENTIKAAEDSLAKLFPTTRDSLAGRMTTPEGGGLKIPVMPEGLSAKEKSAFARSYNWITAYYKPKTSKGNILQSVPNLVSGPMATSVANFLGRDLTNDEAGLVKDFQSKHGHFKKSFDKLFAQNPKKLQFRDNDPSLFLADFDEENISTAVWTGIYNWVATRGGDTLFNDAATINTMLGRDTKNPVSTREYELLGRVGVGRNTLAETLGRDIMNLLHIQTTGQAPHHLESKMANSVGLLAAEIMRDMRVVTTSSIDGKTMAALTGKEASEQSFNYYRIKTQQVEGKEVVAKSLKGIADNLRQANNSVSATSDRMWANIFNGVAEKKAPSFSPIKRVAKTVKGSDQKITKKEQDIIRRQQNRKHFIRDDEWAAFSSLGYDNMARILGQRDENSVHVSQRESQANINDNIERELANFEEFVHMRDESGKEHFYFEHSKWTNGRYGIESTLVNPQGIKSHRAFIGQEGWVSTIDPANGDNRWFWASMLEPLSIGNREQALEKFGPVIEAMRVFVREGEFNPEDVDMITEAVANAGHKAESFTALMNLAKYEEAAVNNETFRTDMAIEIDGKTNGVILSMLQYADGADAKDLLARLGKGGFYAGEYNNFNEFKADGNLDAYEEIATVWMKTLQESNIDQKALRGAQFIFGLLKLKDDDGTRKFVENIEKGGRNLAKSPLMVTNYGSGDQSVQEALGLDFIARVYDMITENPENYELIARAVNAIVPNSMPATTGAPLEVVIDPRAEQLLRNFIEEEFGKPVSAAINDQYARTKAGQKAVNEGLDLMFRMHNAVRNDLIAKATAQGIADGSIVKGVTTLSAEKMQEIDDQIKVLSPQMKTFFSKANTDFNHNMDLSGDRIALKQDSSAYVIEAQYTEGGNRVVAQSDVRVPSSPGVAGGVTTIHSLDALIMAMVYEGDVDVLGVHDAILVGVKDAQAGGEALNKATYDAMNAMTVPQEILRSYTQARKAFGAYLGRDDVDTKALMKDFYNAEGTALRYRNPRAGQFAKPIEGQKAAEARVNDLRATARRSLEIKDEVLKTPDLIVHQYADEIGQTGVTFNSTNVEEMSDTQVENVGKESARSVDEIVHEALYKANVPSEDLGSQPVTEETSPTQYDSEQVVDATNVQQVFDELPATGGKQENEAHKNFLREQVNHFSNMLMTPFKLHMRTKEDAPNYGVMTDSDIYLTNLAQGAQVTSGMLARGIPMSNQEVMAHELNHLVYLEGLSKDSKERRQVERMFQAAREQLDHTAFLTNPATASADEIEGAKATFNHLFYERSGQSLAEFAAFGTTNERFMEALGTVTLRPNKVFSDSFGEIFRNILNTIVDALSTRVLGLKGLRSDQQIVKMLDGMHRINAKKRHAFMVRAEKLAYTYQGAIAKPVNLVGAAVKKALTSDALLNNRFPIVAGPAKFLKLADDKKATEVFRAGLTNVRDNLIGTRNGFFVSTMDEIIGRTKGNAQVRDLARSANVQLDQERKKVKTAMIDNIKASFKTEMSDDDWTAVSKVFLKGDITRLLGLGTNTILELLDNPAAVDTQINRLESQLAGNVNANFYIRQARNLGYYMNTGKSREKVALLNAYNIARVAGNPGVRVSDAVINNVEPIIDQLATLHAMKEMNTEYRNQAANVLRREMAEDADNNGITAVLMAHAGLKEQSKQQFSSLQEYKALAIKGWTKEVYKEGVGLETGTAEDHDALVAQGFIRGARIANDPTDPVQEPRWIYHAPDGALAPYMSTIASLTNDVAKGSGRREVNKKWGATSRDEAATIDTIQINKAKIAAMKEMNARPNGPTGPSQENYMIPIVNPKGEFTDWRYMMSEANKDGLLQKDNNAAEILGSMAGNVVDKVESRKVNKELVNVTKEYWDREGATRSKAYVEIGPHSDNARYREIWAQLPESMQEEVRKVWGGNSFKVRADLVTHMFGYRKASLTELFQKDPEARKWYERLVTDMLTALFGDRAARYVRNAENFLQALTQEVKDVVIVKSGVITIANMLSNTMLLVMNGMSPAKALRYQYEAYRNSSEMIKEQRQVKVLTSELTTKSLSSVERRRKEAEIARLNRRISQNPTYEAYSAGLMPTIVEDVAADTEFTNTLRGKAQRAVSSGIDRGLKGTPSWVREGVKTVVGLPDTEVYRFMNNMVMQSDFMARYAILKDWTEKNGGVSTPEMFGEAEELFVNFDAPTHKGLQYLNDIGIAWFSKYVLRVNRSIARTFAKNPVAATLAVIGVEASGIGIDNPAASSVFGGGDITRIVDNAFGKAMDATDLSMMANIFGLAS
Physico‐chemical
properties
protein length:3220 AA
molecular weight:351767,00000 Da
isoelectric point:5,13440
aromaticity:0,06522
hydropathy:-0,42115

Domains

Domains [InterPro]
IPR023346
25–125
IPR023346
IPR023347
24–152
IPR023347
Protein sequence: M4SML5
1 3220
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Vibrio phage VBP32
[NCBI] 		754072 Schitoviridae > Stoningtonvirus > Stoningtonvirus VBP47
Host Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633
[NCBI] 		223926 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Vibrionales > Vibrionaceae > Vibrio

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGH57223.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ634196 [NCBI]
CDS location
range 45966 -> 55628
strand +
CDS
ATGGCAAACATCTTATACGGGTCTGACGCAGTCGCACAGGTTGAAGCTGCTGAAGGCCCTCTTTCATCTACAGAGCGCCGAATCGTTGAACTAGAAGGTTTAGCTGATGGCACTTATGCGGATACGAAAGGGATTGCTACATCAGGCGTGGGACAGACCGGTCAATTTGCAAATATGTCCTTCAAAGATACAGTAGCAACATTCGAGGAAGAAACTCGTCGAATGATTCCTAACTTTGATTCCCTATCTCCAAAGTTACAGACTGAACTTGTTCAGGCTGCGTATCGTGGTGACTTACAACAATCTCCTAAGACTCGTGCACTAATCAACGAGGGTAACTTCGAGGGTGCTGCACAAGAATTCCTAAATAACCAAGAGTTCCAAACTACTCCTTACAATGCTATCCGTGATCGCATGGCAGATGTCTCTACAGCTCTAGCTGCTGAGGGTGCCCAAGCTCCTGTAGCTCCTTCTGTTGGTGAACAGAAACAAGTACAACTAGCTAATCGTACTCCTCAGAAGCAACAGCAAGTAGCTAATACCTCTGACTCTAAACAATTAGAGCTAGCTGGTTTATCACAAGCAGAACAACGTATCCTAGATCTAGGTATGTCTGAGTACGTACGTAATGGTCAGACTGGTACTGCTGCTTCCCGTGCACAAGAGTACATGGATGCTCAAGATAAGCTTTCTACTATCCAACAACGTCAGGATGAAGAATCTACTAAAGTAATCTTTGAGGATTTGGATAACCCTCTGCAAGCAACTGGTAACACATTGCTCAGTGTTGCCAACACAATCGGAAACATTGCAGGCGGGCTCGTTTCTCTGCCTAGCTCTATTCGCTCTGCTTACAATCTCTCTGATGCGACGAACGAAGGTTTTGCGCAGTATCAGTCGATTCTTGCGAAGGAACAAGCAGGCGTAGCACTAACTCCAGCCGAACGTGAGTTCCAAGGAACTGATGAATACTCTGATATCAAACAAGGTATGGAGTCGATGGCTCGTGCTCAATCTATTCAGGGTGGTTTCGGTATCCTTGGTGACTACGTAAACCAAGAGTTAACTACTGAGTTTGTGAATGAAGGTTCTAAGCTATTCAACGAAGTGGCAGGTGGTGATATCACTATGGGTGAATTCATCTCTGAGTCTGCACGTCTTCTTACTCAGTCTCCGGGTGCTATCGGTCAGGCTACAGTAGAGTCTCTACCATACGTACTAGCTTCTGCTTATAACCTACCTTTGACTGTAGCGTCAGGCTGGGCCAATAACCAACAAGAAGCTCTAGAGGAGTACCAGAAGAACAATGATGGTGCTATCCCTACTGGTCGTGACCTAGCAAACGTAACAATGCTTGCAGGTGGCCAAGCTCTAGTAGATCACTTCGGTGACCGTCTAGTTGGTGGTAAGAACCTTAAGAATCTAATCTCTGGTGCAACTGGTCGTCGTTCTGCAGGCGCAGCCGTAGGCGTAGTACAAGGTACAGCAGGTGAGTTCGTAGCTGAAGGTGGTGCAGAAGTCCTAGGCCAATTAGCTGCTACAGCAGGTAAAGGTGAAGTTGATCTTGCCCAAGCATACGCTGCAGGTCTTCTAGGTGCCGGTGCAGGTGGTGCAACTTCTGGTGCAATCGCAGGCGCTAACATCACAGCTGATGCTATCGACAATGCTCCTGATTTAGGTGAGAAAGTATCATCTGTCTCAGAACGTGCCAAAGGCGCTGTGGAATCTGTTAAGACTGCGGCTACCGAAGCTAAGGATGCAGCAACTAAAGCTGCTCAGACAACCACAGAAGAGCAAACTGAAGCACCTACAGAAGAGAAAGGTCTAGATGTACGTTTGTCAGAAGCATTTGTTGAATCTGACTCTAATCCAGACCAAGCACAAACGATTGAAGCTGATGTACGAGCTGAATACGACGCTCTAAAGACAGAAGCACAAGACATCGTTAAGTCAGGTGTAACTAACGAGACAATCACTGAGGAACAGAAGGACACGATCATTCGTTTCCAAGAAGCTCAGAAGGTTATCCGTGCTCGTAACAAAGAAGTAAAAGCTCGTGAAGCTGCTAAACAAGCTAACCAACTAGCTACTGCCTCTACTAATAACACTGCAACTACCACAGCTGTAGAGAATGTCCTTGGTTCTATTGAACTAGACCCTTCTTCTATTAGTGCTGACCAAGCAGAAGCTATTCTAGGTAACCAAAACCTACGACTAGATGCAGAACAACGTTCTAAGCTACAACACCACGTTCGTGTAGCTAAAACACTAGATGAAGTCTCTAATGAGATTCGTGATGGTGGTAACGGTAACATTGGTATCAATCAGTACATTGAAGAAGTAGGTGCTGCATTAGAGATCGGTGATGTTGCTACTGCTACTGAATCATTAGACGCACTGAAGGCTTGGCAACAACAACACGTTGCTAAACTACAATCTAATGTGCACAACGGTAAGCCGATGACTCCACGTCTACGCGCACAAGTAGCAAAAGAAGTTAAAGCTATGAATGCTGCTGTAGCCAAGTTAGAAAACGACTTAATCTACGCTGATGCACCTACTCAAGAGGAGCAAGCTAATGTCGATGCTAACGTACCTACTACTGATACTGTTAGTGGCAGTGCTACTAATGACACCGAGACTGTAGCCGAGCAGCAAGCACCGGAGGCGGTAGCCGAGGATGCGCCAGCTGCGGAGGCGACACAAGACCAAGTAACCGCTGAACTTCGTGAAATCTTTCAGGAACTAGATTCAGACCCGGCACTTGTAGACCAAGTAGTCACTGGTGTCCTAGATCTAAATGAACAAGGCGTTACATTTGATAGTGCACTTACTTCTCTTAAAGAGCAGTATGGTGAGAACACTATTAAAGCAGCAGAAGACTCACTGGCTAAGTTATTCCCAACTACCCGTGATTCACTAGCAGGTCGTATGACTACTCCTGAAGGTGGTGGTTTGAAGATCCCTGTGATGCCAGAAGGCTTATCTGCTAAAGAGAAGAGTGCATTTGCTCGTAGCTACAACTGGATTACTGCTTACTACAAACCTAAGACTTCGAAAGGTAATATCCTTCAGTCTGTACCTAACTTAGTGTCTGGTCCTATGGCTACATCTGTAGCTAACTTCCTAGGCCGTGACTTAACTAATGATGAGGCTGGTTTGGTAAAAGATTTCCAATCTAAGCATGGCCACTTTAAGAAGTCATTCGATAAGCTATTTGCACAGAACCCTAAGAAGTTACAGTTCCGTGACAATGACCCTAGCTTATTCCTAGCTGACTTTGATGAAGAAAACATCAGCACTGCTGTATGGACTGGTATCTACAACTGGGTAGCAACTCGTGGTGGTGACACTCTATTTAACGATGCAGCTACTATTAATACTATGCTAGGTCGTGATACTAAGAACCCTGTATCAACACGCGAGTATGAACTACTAGGTCGTGTAGGTGTAGGTCGTAACACTCTAGCTGAGACTCTAGGTCGTGACATCATGAACCTATTGCACATCCAGACTACTGGCCAAGCACCACACCACTTAGAAAGCAAAATGGCTAACTCTGTTGGTTTGCTTGCAGCTGAGATTATGCGTGATATGCGTGTAGTTACTACGTCTTCTATTGATGGTAAGACCATGGCAGCACTTACTGGTAAAGAAGCTTCTGAGCAGTCATTCAACTACTACCGTATTAAGACACAGCAAGTAGAGGGTAAAGAAGTAGTAGCTAAGTCTCTAAAGGGTATTGCAGACAACCTACGTCAAGCTAACAACAGTGTTTCAGCTACATCTGATCGTATGTGGGCAAACATCTTTAACGGTGTTGCAGAGAAGAAAGCTCCATCTTTCTCTCCTATCAAACGCGTAGCTAAGACAGTTAAAGGTAGTGATCAGAAGATTACCAAGAAAGAACAAGACATCATCCGTCGTCAGCAGAACCGTAAGCACTTCATCCGTGATGATGAATGGGCTGCATTTAGCTCTCTGGGTTACGACAATATGGCTCGTATCCTTGGACAACGTGATGAGAACTCTGTGCATGTATCTCAACGTGAAAGCCAAGCTAATATCAATGACAACATTGAGCGTGAGCTAGCTAACTTCGAAGAGTTCGTGCATATGCGTGATGAATCAGGTAAAGAGCACTTCTACTTTGAGCACTCTAAGTGGACCAATGGCCGTTACGGTATTGAATCTACTCTAGTGAACCCTCAGGGTATCAAGTCTCACCGTGCATTCATTGGCCAAGAAGGTTGGGTATCTACTATTGATCCAGCTAATGGCGATAACCGTTGGTTCTGGGCATCTATGCTTGAGCCTTTAAGTATCGGTAACCGTGAACAAGCACTAGAGAAGTTTGGCCCTGTTATTGAAGCTATGCGTGTATTTGTACGTGAAGGTGAGTTCAATCCAGAAGATGTAGATATGATCACTGAGGCTGTAGCAAATGCAGGCCATAAAGCTGAATCATTTACTGCTCTGATGAACCTAGCTAAGTACGAAGAAGCAGCTGTTAATAACGAGACTTTCCGTACAGACATGGCAATTGAAATCGATGGTAAGACTAACGGTGTTATCCTTTCGATGCTTCAATATGCGGATGGTGCCGATGCTAAAGACCTACTAGCACGTCTTGGTAAGGGTGGTTTCTATGCAGGTGAATATAACAACTTCAATGAGTTTAAAGCTGATGGTAACTTGGATGCTTACGAAGAGATCGCTACGGTATGGATGAAAACTCTTCAAGAGAGCAACATTGACCAGAAAGCACTACGCGGTGCTCAGTTTATCTTTGGCCTACTTAAGCTTAAAGATGATGACGGTACTCGTAAGTTTGTAGAGAACATTGAGAAAGGTGGTCGTAACCTAGCTAAGTCTCCACTGATGGTAACTAACTATGGTTCAGGTGATCAGTCAGTACAGGAAGCTCTAGGCCTAGACTTCATTGCTCGTGTATACGACATGATTACTGAGAACCCAGAGAACTACGAACTAATTGCTCG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Gene Ontology

Description Category Evidence (source)
GO:0003796 lysozyme activity Molecular function Inferred from Electronic Annotation (UniProt)
GO:0031640 killing of cells of another organism Biological process Inferred from Electronic Annotation (UniProt)
GO:0042742 defense response to bacterium Biological process Inferred from Electronic Annotation (UniProt)

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.